《超人前传第三季》延续了前两季的情节，克拉克·肯特的成长之路愈发扑朔迷离。在上一季的结尾，克拉克的父亲乔纳森·肯特为了挽救自己的儿子，不惜牺牲自己，获得了一时的超人能力。这个情节也成为第三季的开端。 第三季中，克拉克和拉娜的感情经历了许多波折，起伏不断。克拉克逐渐掌握了新的超能力，距离成为真正的超人似乎只有一步之遥。他变得更加强大，但也更加面临着自己超能力所带来的责任。 然而，剧情在最后一集引入了一个神秘的女孩角色，她拥有比克拉克强大百倍的能力，而她的出现是为了带走克拉克，回到她自己的星球。克拉克被迫跟随这位神秘女孩离开，这一季的结尾充满了伤感和离别的情感。 此外，其他角色的命运也在第三季中发生了重大变化。拉娜前往巴黎，克洛伊和她的父亲在搬进新居后遭遇了一场爆炸，而皮特则决定离开Smallville。这一季的情节充满了戏剧性和情感冲突，为整个系列剧的发展埋下了更多伏笔。 《超人前传第三季》继续探索了克拉克·肯特成长为超人的道路，同时也呈现了各种复杂的人际关系和角色命运的变迁，使观众陷入了情感的波涛之中。
